农学院前身为新疆八一农学院农学系，是建校之初首批设立的六个系之一。 1995 年 4 月 21 日由农学系和植物保护系合并成立农学分院。 1998 年 12 月正式更名为新疆农业大学农学院。农学院建有作物遗传育种、作物耕作栽培、植物病理、昆虫、生理生化五个教研室。共有作物遗传育种实验室、作物耕作栽培实验室、植物病理实验室、昆虫学实验室、防治学实验室、生理实验室、生化实验室。

　　农学院现有农学、植物保护、生物技术、生态 4 个本科专业；有农业技术推广、土地信息管理、种子经营管理、种子工程、植物保护、草原保护、森林保护等多个专科专业；有昆虫学、植物病理学、作物遗传育种、耕作栽培、植物生理生化等五个硕士学位授予点。

　　农学院现有教授 7 人，副教授 28 人，具有博士学位的教师 4 人，硕士生导师 21 人。农学院具有一支教学经验丰富、科研能力强、学术水平高的师资队伍。在教书育人、科研开发和技术推广应用总发挥着积极作用。为新疆的经济建社和社会发展做出了积极贡献。

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