上海中医药大学原名上海中医学院，1956年9月创办，是中华人民共和国成立后首批建立的4所中医学院之一。1993年12月经国家教委批准更名。1994年8月，著名医学家、第八届全国人大常委会副委员长吴阶平任名誉校长。上海市中医药研究院于1985年11月成立。与学校合署，集教学、医疗、科研于一体，充分发挥中医药特色和优势。在建校30周年和40周年之院，江泽民主席两次题词祝贺。

　　上海中医药大学建校40多年来，特别是党的十一届三中全会以来，在邓小平理论和党的基本路线指引下，认真贯彻执行党的中医政策，继承和发扬中医中药，基本形成了本科普通高等教育、研究生教育、成人继续教育、港澳台生教育和外国留学生教育等培养高级中医药人才的教育体系，成为我国高等中医教育和教学、中医医疗、中医科研的一个重要基地。目前，全校系统有6千多名师生员工，其中有6百多名高级专业技术人员，1名中国工程院院士。设置5个两级学院，5个系部，3所附属医院(共有1800张病床，每年就诊250万人次)，11个研究所，8个研究中心，1家出版社。图书馆收藏中医药书籍1万多种。有我国创建最早的医史博物馆。中医基础医学被国家教委评为国家理科基础科学研究和教学人才培养基地，中医外科学、中医基础理论分别是国家教委、国家中医药管理局重点学科，中医内科学、中药学、针灸学是上海市重点学科，中药生物工程研究室、肝病研究中心是国家中医药管理局重点研究室，有中医内科学、中西医结合基础、中药学等10个博士学位授予点和17个硕士学位授予点，1个中医专业博士后流动站。有中医肿瘤、中医急诊、中医推拿、中医胆石病等25个全国、市中医专病专科协作中心，中医肝科、中医外科学9个市医学领先学科。已培养中医药本专科和理工科学习中医、西医学习中医第二学士学位毕业生等7千多名，博士、硕士毕业生5百多名，2名博士后工作人员出站。80年代以来获省部级以上科研成果奖3百多项，其中《药用植物洋地黄细胞培养及其强心甙的生物转化研究》、《高等中医院校教学参考丛书中医内科学》分获国家科技进步二、三等奖。

　　上海中医药大学是世界卫生组织设在我国的传统医学合作中心和国际针灸培训中心，已为50多个国家培养了3千多名本国的中医师。与日本、韩国、美国等10多个国家30多个大学、科研、医疗机构建立合作关系。50多名外国学者受聘担任名誉教授和客座教授。每年约150人次专家出国讲学或参加国际学术会议。该校成为我国中医药学术对外交流的一个重要窗口。