1989年北京发生的政治风波平息之后，外交学院党委坚决贯彻了党中央、国务院对高等学校提出的要求，把党委工作的中心任务确定为：组织全院师生员工认真学习贯彻党的十三届四中全会精神，深入进行坚持四项基本原则、反对资产阶级自由化的教育，坚持社会主义办学方向，从思想上、政治上、组织上落实四中全会精神和一系列方针政策，把我院办成培养党的外交、外事干部的坚强阵地。

　　外交学院自1980年复校以后，一直坚持把学院办成培养外交干部的基地，学生的培养方向和课程设置均根据外交部的要求制定。自1985年起，本科毕业生绝大部分由外交部及所属单位录用。但从1990年起，毕业生开始双向选择，外交部扩大录用干部的渠道，每年从外交学院100名左右的毕业生中只能录用30人左右，给学院的毕业分配、办学规模乃至办学方向都带来了新的问题。1991年4月4日，外交部党委在讨论外交学院《当前需要解决的几个问题》时决定，外交部及部属单位每年通过考试，从外交学院择优录用毕业生约60人左右，其余通过双向选择落实就业单位后由国家派遣。

　　为进一步贯彻我院培养既有外语知识、又有专业知识的复合型人才的方针，经外交部批准，我院于1995年在原国际法教研室和国际法研究所的基础上成立了国际法系，并于1996年参加全国普通高等学校的统一招生。同时，经外交部批准，我院自1995年10月起筹建国际经济系。1998年，经报外交部和国家教委批准，外交学院国际经济系正式成立，并于同年开始参加全国普通高等学校的统一招生。

　　学院从1993年开始，着手研究实施学分制的可能性。并以本科第一学位九二级作为试点，从三年级起试行学分制。1994年底学院成立了学分制工作小组，1995年完成了学分制方案的起草工作，制定了《外交学院本科学分制条例》、《关于本科逐步实行学分制的若干说明》、《本科课程考核实施细则》、《选课实施细则》、《三套课程设置方案》等。

　　学分制的实行，为我院培养高素质、复合型外交外事人才奠定了体制方面的基础，同时也推动了我院的教学观念的更新和课程设置的改革，在我院的发展史上具有重要的意义。

　　从1994年开始，外交学院每年举办“外国青年外交官汉语语言培训班”，以学习汉语为主，兼学一些有关中国对外关系、中国历史、社会和文化等课程。从1996年开始，我院举办了多期“非洲中青年外交官讲习班”。

　　到1999年底，与我院建立校际交流关系的外国院校包括：阿曼外交学院、蒙古国立大学国际关系学院、赞比亚外交学院、

　　1989—1999年期间，我院曾派出50余名教师，到国外学习、进修、考察、参加国际会议，以及作为访问学者进行讲学或学术交流。

　　在此期间，学院还聘请了美国、英国、比利时、法国、加拿大、澳大利亚、日本、韩国、缅甸等国家的专家、教师130余名来我院授课。

　　从1994年3月起，外交学院开设了“当代中国与世界”专题报告课，邀请外交部及其他有关部委领导同志来我院，就当前的国际国内形势、中央的方针政策等举办报告、讲座。1994年3月26日，农业部常务副部长吴亦侠同志来我院，作题为“中国农业形势”的报告，是“当代中国与世界”专题报告课的第一讲。此后，国务院港澳办公室、国务院发展研究中心、最高人民法院、外交部、对外经贸部、中国国际问题研究中心等几十家单位的领导、专家学者先后到学院做专题报告。

　　从2003年起，我院在吴建民院长的倡导下创办了“外交学院论坛”和“外交学院讲座”，聘请国内外一流的专家、学者来我院，就政治、经济、科技、文化、外交等方面的前沿课题举办论坛和讲座，以开阔学生的视野、丰富学生的知识、提高学生思想认识的层次。原国务院副总理钱其琛，著名物理学家、诺贝尔物理奖获得者丁肇、中国人民解放军副总参谋长熊光楷，前联合国秘书长加利，世界著名物理学家、诺贝尔物理学奖获得者杨振宁等十几位知名人士来我院发表演讲。