国家级重点学科是师资、科研、设备等综合实力都是具有国家一流水平的学科。 2008年至今教育部在中国教育和科研计算机网站上陆续公布了四批高等学校特色专业。以下是上海的高校中所涉及的部分国家级重点学科和特色专业。

　　◆复旦大学◆

　　重点学科：马克思主义哲学，外国哲学，政治经济学，世界经济，金融学，产业经济学，政治学理论，国际关系，汉语言文字学，中国古代文学，传播学，历史地理学，基础数学，应用数学，运筹学与控制论，理论物理，凝聚态物理，光学，物理化学，高分子化学与物理，生理学，神经生物学，遗传学，生态学、电路与系统，微电子学与固体电子学，人体解剖与组织胚胎学，病原生物学，病理学与病理生理学，内科学，儿科学，神经病学，影像医学与核医学，外科学，眼科学，耳鼻咽喉科学，肿瘤学，妇产科学，药剂学，中西医结合基础，中西医结合临床，社会医学与卫生事业管理，流行病与卫生统计学，中国近代史，计算机软件与理论等52个二级学科。(以上学科包含一级学科、二级学科和一级学科中所含的二级学科)

　　特色专业：哲学，汉语言文学，新闻学，物理学，集成电路，软件工程，临床医学，预防医学，基础医学，生物科学，经济学，历史学，数学与应用数学，化学。

　　◆上海交大◆

　　重点学科：凝聚态物理，工程力学，机械制造及其自动化，机械设计及理论，材料学，材料加工工程，动力机械及工程，制冷及低温工程，电磁场与微波技术，通信与信息系统，控制理论与控制工程，模式识别与智能系统，计算机软件与理论，船舶与海洋结构物设计制造，管理科学与工程，内科学，儿科学，外科学，口腔基础医学，口腔临床医学，生物医学工程等41个二级学科。(以上学科包含一级学科、二级学科和一级学科中所含的二级学科)

　　特色专业：计算机科学与技术，电气工程与自动化，机械工程及自动化，集成电路，信息安全，信息工程，通信工程，软件工程，船舶与海洋工程，工业工程，土木工程，生物技术，生物医学工程，临床医学，口腔医学，医学检验，热能与动力工程，自动化，工程力学，生物工程，护理学。

　　◆同济大学◆

　　重点学科：海洋地质，工程力学，材料学，城市规划与设计，岩土工程，结构工程，桥梁与隧道工程，道路与铁道工程，交通运输规划与管理，环境工程，机械设计及理论等13个二级学科。(以上学科包含一级学科、二级学科和一级学科中所含的二级学科)

　　特色专业：德语，工业设计，软件工程，计算机科学与技术，建筑学，城市规划，土木工程，环境工程，车辆工程，交通工程，工程管理，地质学，地质工程，机械设计制造及自动化，历史建筑保护工程，生物信息学。

　　◆华东师大◆

　　重点学科：教育学原理，课程与教学论，教育史，基础心理学，自然地理学，生态学，光学，基础数学，中国古代文学等18个二级学科。(以上学科包含一级学科、二级学科和一级学科中所含的二级学科)

　　特色专业：汉语言文学，历史学，心理学，对外汉语，地理科学、数学与应用数学、化学、生物科学、软件工程，哲学，学前教育。

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